Bidang Keagamaan dan Pembinaan merupakan program utama GEMMFA yang berfokus pada penguatan keimanan, peningkatan kualitas ibadah, serta pembentukan akhlak mulia di kalangan remaja. Program ini dilaksanakan secara rutin dan berkesinambungan sebagai upaya menciptakan generasi muda yang beriman, berilmu, dan berakhlak baik. Kegiatan dalam program ini meliputi: - Kajian rutin remaja yang dilaksanakan setiap malam Sabtu - Pembelajaran tahsin Al-Qur’an untuk memperbaiki bacaan - Program tahfidz (hafalan Al-Qur’an) secara bertahap - Pembinaan akhlak dan pemahaman dasar-dasar keislaman Melalui program ini, GEMMFA berupaya menjadikan masjid sebagai pusat pembinaan generasi muda yang tidak hanya memahami agama, tetapi juga mampu mengamalkannya dalam kehidupan sehari-hari.